对船舶同步发电机的保护主要有：外短路保护、过电流保护、缺相保护、失压保护等，这些保护都是通过作为发电机主开关的断路器实现的。当检测到这些故障后，信号机构作用在断路器的四连杆机构称为脱扣器上，使断路器跳闸，切断发电机与外部负载的电气连接，从而保护发电机不被损坏。

　　由于发电机组组成的船舶电站还设有分级卸载装置，当过载发生时能自动卸掉次要负载，它其实也是对发电机的过载保护。并联运行时的有功、无功自动分配装置在某种意义上也是避免发电机过载的措施。